順軍輕騎縱橫雪域高原，一時間大雪滿弓刀，百騎奔馳，衝破浮屠廟宇。葛爾丹即便有經(jīng)天緯地的才能，以區(qū)區(qū)藏軍部衆(zhòng)，也難以抵擋順軍將士的猛烈衝擊，當(dāng)時大敗，潰不成軍。
原本依附於葛爾丹和達(dá)賴掀起叛亂的前後藏地方貴族，也相繼歸附大順，四處截?fù)襞衍姡蝿菟查g扭轉(zhuǎn)。
各大寺廟紛紛向順軍提供糧食、茶葉、奶茶、酥油，李懋亨揮兵急進(jìn)，一路衝擊至日喀則，葛爾丹妄圖閉城死守。
但是大順軍將士用燧發(fā)槍火力壓制城頭，先鋒銳士登城強(qiáng)攻，半天時間就跨過土圍，攻入城中。
葛爾丹一敗再敗，幾乎產(chǎn)生了服毒自殺的想法。
他是一名虔誠的黃教信徒，此次起兵反順，不僅僅是因爲(wèi)得到了其兄長僧格渾臺吉的授意。
更主要還是因爲(wèi)葛爾丹極爲(wèi)尊敬的達(dá)賴也贊成興兵反順，所以他才四處串聯(lián)，請準(zhǔn)軍進(jìn)入雪區(qū)驅(qū)逐大順。
現(xiàn)在兵敗如山倒，達(dá)賴立即變換臉色，準(zhǔn)備派遣僧兵捉拿葛爾丹，將藏軍屠殺米剌印和秦中士大夫的罪責(zé)，全部扣到葛爾丹一人頭上。
葛爾丹驚聞噩耗，空前震驚，他在絕望之中跳下山崖自殺，摔得粉身碎骨，屍骨無存，此後雖然經(jīng)過順軍多番搜尋，也沒能找到葛爾丹的遺體。
這還在雪區(qū)高原上留下了葛爾丹涅槃成佛的傳說，後來受到大順軍血腥清洗和報復(fù)的黃教僧侶，因此編造出了葛爾丹未死，而是涅槃成佛，將在百年後如蓮花般歸來，領(lǐng)導(dǎo)黃教僧俗驅(qū)逐順軍統(tǒng)治的傳說。
而五世達(dá)賴，他逼死葛爾丹，又逮捕了葛爾丹左右的一批準(zhǔn)部貴族。妄圖用這些衛(wèi)拉特蒙古貴族王公的首級，來平息大順軍的怒火。
可李懋亨早就獲得了朝廷的授意，此次進(jìn)入雪區(qū)，一定要徹底改變雪域高原上的政治結(jié)構(gòu)，鞏固大順的統(tǒng)治。
李懋亨率軍進(jìn)入拉薩以後，立刻將五世達(dá)賴誘捕，押解回京。接著又召集了前後藏的各主要地方貴族、大喇嘛，召開了噶廈會議，重新選拔了出身青海的一位幼齡童子爲(wèi)第六世達(dá)賴。
李懋亨向朝廷上書，請以大將趙自牢爲(wèi)西藏都督府都督，並從雪區(qū)的地方貴族中選擇了頗有威望，又協(xié)助大順軍進(jìn)兵的四名首領(lǐng)爲(wèi)副都督。
爲(wèi)避免權(quán)力集中於一名雪區(qū)地方的世襲貴族手中，順朝採取了衆(zhòng)建諸侯的方式，往往同時冊封四到六名親附大順的貴族首領(lǐng)爲(wèi)副都督。
一般情況下，雪區(qū)的軍政要務(wù)，都由這幾名副都督共同辦理，由順朝直接委派的都督，則並不負(fù)責(zé)日常軍政事務(wù)，只有在面臨重要危機(jī)的時候，纔會插手干涉雪區(qū)事務(wù)。
同時，爲(wèi)了削弱這些地方世襲貴族首領(lǐng)的權(quán)力，順朝又強(qiáng)制規(guī)定他們擔(dān)任副都督以後，必須離開其世襲領(lǐng)地，到拉薩來常住、辦公。
以此分離了這些地方豪強(qiáng)同自家領(lǐng)地間的關(guān)係，使得擔(dān)任副都督的重要貴族首領(lǐng)，喪失或不方便利用自身領(lǐng)地的兵力發(fā)動叛亂。
稍稍整理雪區(qū)軍政要務(wù)以後，李懋亨便命趙自牢領(lǐng)兵二千人屯拉薩，自己率領(lǐng)其他兵馬先行返回青海。
此役大順軍以風(fēng)馳電掣般的驚人速度，快速行軍，翻閱了數(shù)千米高的雪域山區(qū)，在絕域荒原高速行軍六千餘里，迅速戡平了葛爾丹之亂。
又以強(qiáng)大的武力爲(wèi)依託，對雪區(qū)叛亂的僧俗權(quán)貴領(lǐng)袖展開了血腥清洗，誅除了大小僧俗貴族十幾家，重新建立了以都督府的四大副都督爲(wèi)首的雪區(qū)軍政機(jī)關(guān)，鞏固了順朝對雪區(qū)高原的支配。
從這以後，直到順朝與盤踞印度次大陸的呆迷兒帝國展開爭霸戰(zhàn)爲(wèi)止，雪區(qū)都督府獲得了長達(dá)數(shù)十年的太平安定時期。
也是在這段時期內(nèi)，來自順朝的語言、文字、文化、商品，開始大量流入雪區(qū)，增強(qiáng)了青藏、川藏等地之間的往來交流。
不少雪區(qū)僧俗兩界的大貴族子弟，也紛紛前往東京求學(xué)，或受大順爵位封號。
但是在當(dāng)時，李懋亨迅速戡平雪區(qū)之亂的巨大戰(zhàn)功，卻沒有引起多少人的注意。
因爲(wèi)就在葛爾丹掀起叛亂的同一時間，他的兄長，執(zhí)掌西蒙古四衛(wèi)拉特聯(lián)盟的僧格渾臺吉，已經(jīng)趁著順軍注意力集中到西南一隅的時候，趁機(jī)出兵，繞行阿爾泰山之北，從大順軍勢力所不及的漠北草原出發(fā)，插手到了喀爾喀蒙古的內(nèi)亂之中。
漠北的喀爾喀蒙古，本有扎薩克圖汗、土謝圖汗和車臣汗三部。
崇德三年，三大汗分別派使來瀋陽，向皇太極呈表稱臣，獻(xiàn)上“九白之貢”，即每年進(jìn)貢白馬八匹，白駱駝一頭。蓋清崇白，貢此表示吉祥。皇太極大喜，他曾打算參照漠南蒙古設(shè)四十九旗例，在漠北亦設(shè)若干旗，不料獲鹿大戰(zhàn)時突然病死，而未推行。
多爾袞掌權(quán)以後，試圖在喀爾喀8個札薩克，分左右翼，從而使喀爾喀蒙古與清中央政府的政治聯(lián)繫更加密切。
但這時候清軍深陷關(guān)內(nèi)戰(zhàn)爭，多爾袞被大順軍連續(xù)擊敗，最終在徐州之役中被李來亨生俘。
清軍在漠北草原上的威望也因此遭到了沉重打擊，此後，喀爾喀三部之間發(fā)生紛爭，扎薩克圖汗被殺害，所隸部衆(zhòng)多歸附土謝圖汗，新汗要求索回，沒有成效，雙方形成僵局。
扎薩克圖汗於是便向準(zhǔn)噶爾部求援，僧格渾臺吉藉此機(jī)會，插手到了喀爾喀三部的內(nèi)亂之中。
他在天山南北實(shí)行了總動員，領(lǐng)兵三萬騎，繞行阿爾泰山之北，突然衝進(jìn)了漠北草原。
準(zhǔn)噶爾人獲得了札薩克圖汗的支持，沿途有喀爾喀蒙古人嚮導(dǎo)引路，因此可以大膽行軍，快速突襲，瞬間就打垮了喀爾喀三部中實(shí)力最強(qiáng)的車臣汗部，與札薩克圖汗的軍隊(duì)聯(lián)合於一處，接著進(jìn)攻了土謝圖汗和黃教大喇嘛哲布尊丹巴的牧地，劫獲駝馬牛羊成千上萬，兵力也擴(kuò)大至了四萬騎之衆(zhòng)。
準(zhǔn)噶爾、喀爾喀兩部聯(lián)軍，合兵總計(jì)約四萬五千騎兵，接著南下闖入漠南草原。