芙蓉島位於掖縣偏東北方向的太平灣內，與王徐寨前所相對，是昔日萊州水師的所在地。起初設立的目的是爲了抵禦倭寇和海盜，但後來隨著倭寇消散，海盜也不成氣候。這些水師也逐漸轉性，變成了向東江軍運送糧草、輜重的運輸船隊。
但隨著東江軍的覆滅，萊州水師的實力再次縮減。大部分被編入步卒，還有一些被直接遣散歸家，只保留了很少的一部分船隻艱難維持。到這個時候，只剩下十艘老舊的海船，不到二百的水兵。
在目前的整個登萊地區，只有在蓬萊水城有大規模水師。他們以黃蜚治下的昔日東江軍爲基礎，大約有海船七八十艘，一千餘水兵。
周顯知道水師的重要性，但建水師太耗錢，而且或許在很長時間內不會有太大用處。他在重新整編萊州五個千戶所的時候，將芙蓉島的水師劃分到王徐寨前所，並且暫時也不打算擴充這支水師。
但聽李丁這麼一說，他感覺自己真的要重新考慮這件事情了。如若將海船的數量擴增到二十艘，就有足夠的船隻用以和朝鮮，甚至是扶桑交易，每年獲取百萬兩白銀應該不成問題。那樣，自己便可以在不壓榨百姓的前提下養活所有士卒。或許在將來，再建立起一支和蓬萊水師相當實力的水師也未可知。
文志通雖然從周顯的話中，看出周顯除了想從獲取銀子之外，還有更深的考慮。但他始終覺得既然朝廷已經禁海，這樣公然出海，一旦被發現，後果會很嚴重。他試圖以此說服周顯，但發現後者根本毫不在意。
周顯反而給文志通詳細敘說了自己對將來的整體規劃，到最後，他也不得不承認那樣的規劃真的很有吸引力。他也確確實實的感受到周顯真的是在做事情，而且後者的志向、心志遠比自己想象的更爲闊大，也更爲令人服膺。說著說著，事情得到了反轉，勸說者最後變成了被勸說者。他最終擡起手，躬身向周顯拜道：“屬下願意協助大人成就大事，不管將來是成還是敗，屬下絕不後悔。”
文志通之前給周顯的感覺是圓滑、而又通曉政務。他知道自己無論將來要做什麼事情，都繞不開他，因而打算對他坦誠以待。此刻他聽到文志通真誠的表言，心中欣喜萬分，連忙拱手還禮道：“能得文同知相助，此事必成。從今之後，萊州所有的政務都麻煩文同知了。但凡你覺得對的，儘管去做，而不必事事都告訴我。”
周顯的話語，等於給了文志通知府的權限。他心中感激，連忙拱手道：“多謝大人。”
莊稼的收割，打糧，入庫，然後再播種，這一切大約耗費兩個月時間。雖然因爲旱災的影響，收成並不好，甚至可以說極壞。但交清稅收之後，堅持兩三個月時間應該不成問題。之後的日子，或許還是在饑荒中渡過。
亂世，最苦的到底還是百姓。
在這段時間內，無論是塞外還是中原都發生了很多事情。
首先是盧象升率精兵奇襲豫南，趁革左五營根基不穩，徹底打垮了他們。除老回回馬守應和革裡眼賀一龍率數百騎兵狼狽逃出之外，近八萬農民軍基本上全軍覆沒。剩下的三營主將要麼在戰場上被擒殺，要麼被俘虜之後被斬殺示衆，革左五營自此之後成爲歷史。
接著，盧象升以左良玉、賀人龍、李國奇三部人馬與南陽的農民軍對峙。而他繼續率部北上，在很短的時間內又打敗了小袁營，將袁時中驅趕到深山之中。
在塞外，圖爾海以雷霆之勢攻下了歸化城，將科爾沁部全員驅趕了出去。在科爾沁部的祈求下，皇太極令努爾哈赤之孫博羅率滿、蒙、漢共計十二個牛錄，三千六百人遠征歸化，妄圖將圖爾海再次趕回青海。
在鬆錦前線，形勢也有了新的變化。洪承疇率大軍進駐寧遠，八總兵也率領各自人馬陸續到達。明清兩軍在松山和杏山之間多次交戰，其中，吳三桂在乳峰山一帶大破清軍。明軍取得了首勝，士氣大振。雖然錦州的仍舊與城外完全隔絕，但形勢似乎在逐步朝著對明軍有利的方向發展。
而在萊州，很多事情也有了變化。丁志鬆和韓括的黑白臉的唱和下，趙家雖然滿心不滿，但最終還是讓出了那座鉛礦。而在丁志鬆的勸說下，鐵礦裡的四百礦工，加上他們的親屬六百多人最終同意讓出鐵礦。一部分人繼續充當礦工，由官府每個月按時發放銀子。還有一部分青壯被編入了火炮場，充當力工以及護衛。而他們的家屬，也被丁志鬆安排在了火炮場充當雜役。
經過這一段時間，原有的火炮場已經被清理出了一片區域。但招募的那些工匠只懂得如何製作火藥和最原始的火繩槍，根本沒有接觸過更爲複雜的遂發槍。而火繩槍，周顯又不想要，心中想著只有等趙航來了之後再開制了。
而周顯也開始逐步行動，恩威並施，接連收回了平度煤礦，昌邑鐵礦，濰縣煤礦等礦場。將那些小礦、私礦要麼直接關閉，要麼收爲官有。而那些空出來的礦工，大部分被分派到新的官方礦場中，還有一部分被編入鄉勇，充當將來儲備軍。
收礦過程中，並非一帆順利。其中在收回平度煤礦的時候，就曾發生在佔據礦場的豪強支持下，礦工圍攻官府的情況。好在周顯及時到達，命士卒攻殺了五十多個礦工，並直接將那家豪強的家主以及有關的人員全部直接斬首示衆。
這件事之後，收礦進程變的順利了很多，但周顯在萊州的名聲也變的有點慘不忍睹。在民間已有人開始有人稱呼他爲小人屠，而同時也讓他在萊州獲得了徹底的控制權。
收礦的同時，周顯將自己的大部分精力都花費在了軍中，訓練出一支強兵是他的首要目標。其中，各式各樣的小問題遇到很多，但整體而言還算順利。