廣西方面集結完畢，發起西南戰役前夕，周士相特意給廣西巡撫邵九公發去急遞，命其全權節制王有喜的第四鎮、王興的第十鎮、盧光祖的遠征軍第二鎮、廣西新建的狼兵第三鎮。此四鎮同時合編爲西南野戰軍團，軍團都指揮一職由邵九公暫代。大軍所需糧草輜重則由兩廣總督宋襄公並廣西布政使張自昌負責。因廣西殘破，難以承擔大軍所需糧草，因此西南野戰軍團的糧草主要是廣東方面經由水路輸送而來。這當中有近一半是遠征軍從安南運回的稻米，即便如此，廣東的壓力也很大，因爲這次西南戰役，是軍政同時著手。
軍帥府的要求是大軍每佔領一地，就要立即恢復當地民生，設官治民，召集流亡，恢復生產。前者容易，後者卻是複雜得多。不僅需要大量的官吏，還需要大量的糧草賑濟百姓，其它如農具種子、簡單的生活用具數量更是驚人。宋襄公爲此曾致書周士相，坦稱西南戰役一開，廣東近年來所有產出將盡數爲之耗空。未來雲貴兩省所需要的官吏數目也將抽走廣東好不容易培養出來的人才，可謂從此粵省再無閒人。
周士相在回信中對宋襄公如此說道：“粵省是我太平軍最先光復的省份，也最早進行建鄉設村，昔有越國十年生聚，十年教訓，方有滅吳之成功。今以廣東一省力擔西南，苦在眼前，卻利在千秋。唯有使西南儘快安定，百姓不再飢餓，我輩纔算光復成功。否則，地方仍不靖，百姓仍捱餓，爲活男而溺女，爲活子而賣妻，光復又有何意”
邵九公沒有想到他還能重新東山再起，成爲領軍大員。
去年的柳州之戰，邵九公指揮不利，若不是第五鎮在於世忠的指揮下拼死南下，只怕廣西早就落入線國安之手。戰後，邵九公被升任廣西巡撫，看著是出任封疆大吏，但對於重視軍功的太平軍而言，邵九公的前途明顯不如那些直接領軍的同僚明亮。雖然定武朝廷組建後，邵九公依舊得封新豐侯，但這個侯爺的含金量遠不如同爲侯爵的葛義、鐵毅，及被追贈爲忠國公的於世忠，蔣和、蘇納等人。並且長期在廣西，遠離南京政治中心，使得邵九公也以爲自己被大帥冷落，一度有些灰心，甚至生了告老回江西老家的念頭。不想，遠在千里之外的大帥並沒有忘記他，重新委他以重任，雖是暫代都指揮，邵九公卻知這是大帥給自己的一個機會。接到組建西南野戰軍團的公文時，邵九公當真是萬分狂喜。
命令盧光祖和王有喜他們善待吳軍俘虜，自不是邵九公善心發作，而是周士相對他有明確的要求。周士相要求邵九公對吳軍和清軍要區分對待，要以攻心爲上，攻城爲下。對於頑固抵抗的吳軍要堅決予以殲滅，對於主動放下武器投降的吳軍將士則要善加安撫，絕不能一昧殺戮。
周士相如此要求自然是鑑於吳軍從某種程度上來說，已經不再是助紂爲虐的綠營兵，並且吳軍的成份十分複雜，真正屬於吳三桂的嫡系兵馬恐怕不足四分之一，餘下都是原明（清）軍各部，派系複雜，內中不乏首鼠兩端之輩。對這些人，適當的拉攏很有必要，不但可以減少太平軍的傷亡，也可加快戰爭的進程。單純的殺戮固然可以令吳軍恐懼，但卻也會讓雲貴的吳軍沒有退路，和太平軍死戰到底，這顯然是不符合此次西南用兵意圖的。
快打快進，以迅雷不及掩耳之勢奪取雲貴，是周士相爲西南之役定下的基調。唯有快，才能迫使吳三桂從中原分兵回援，如此便會影響他和滿清的決戰，在戰略上達到了牽制吳軍北上腳步的目的。當然，在一些人看來，周士相此舉也是間接幫了滿清的大忙，不過在周士相自己看來，這個忙必須幫。因爲如果不幫福臨這個忙，周士相就無法將滿州老老少少全堵在北京一鍋端。滿州退回關外成爲後金，重演萬以來的史，周士相是絕對不願意的。要麼不做，要做，就做得乾淨。
周士相要打的是滅族之戰，吳三桂動作太快，只會讓滿清放棄北京逃往關外。周士相依稀記得前世史中，當大江南北遍唱《逐滿歌》，皆誦《革命軍》時，搖搖欲墜的滿清是準備逃往關外，逃回他們從漢人手中搶來的所謂老家的。若不是袁世凱搞了優待清室的條文，恐怕滿清真的就此出關。
前世，周士相很遺憾滿清沒有逃出關外，因爲那樣的話，滿州必定會被徹底清算，畢竟兩百多年後，世界已經是熱兵器時代。沒有所謂的優待清室條款，逃出關外的滿清註定會被清洗掉，從而就不會有幾十年後“招魂”，更不會有什麼紫氣東來，天壇祭祖，滿屏的辮子。
周士相卻不希望滿清逃出關外，因爲太平軍嚴格來說還是支冷兵器的部隊，如果滿清逃出關外，就會加大圍剿他們的難度。畢竟關外現在根本沒有漢人，沒有數十年時間，是不可能讓關外恢復到萬以前狀態的。那時，關外有三百多萬漢人。沒有漢人在那紮根，完全要靠軍隊一次次出關“掃蕩”如游擊隊般存在的滿州人，這個難度不是一般的小。關外很大，白山黑水，斬草不除根，春風吹又生。
明清之爭，亦或漢人和滿州的這場持續了四十餘年的戰爭，周士相早在香山時，就爲之定了性兩個民族，只能有一個存在。
想要一勞永逸解決滿州，惟有將他們留在北京。所以周士相必須發動內戰，他不相信吳三桂會和他一樣對滿州有著滔天血海之仇。
福臨放棄北京出關是一個假設，另一個假設就是福臨向吳三桂投降，滿州人和那幫替滿州做狗的漢奸搖身一變成爲永大明的官員，福臨甚至還能混個什麼公，什麼侯，或者什麼王。這看起來很荒唐，可卻有著現實的可能性。
無論哪個假設，對吳三桂動手都是迫在眉睫的事。第一步就是牽制吳三桂，所以西南戰役必須快，若是在雲貴耽擱得久了，對中原戰局的影響便不會太大。雖然對雲貴用兵，周士相對外宣稱的是解救邊外的李晉王，但明眼人都知道這是太平軍和關寧軍內戰的開端，這沒有什麼可諱言的。周士相從來不在乎所謂明眼人的看法是什麼。