話說神農得了褚鞭，與玄都大法師拜別之後，再次踏上了行程。如此又過了數年，神農已經記下上千種對人族有益的藥草，更是找到數種可能種植的種子。
一日，神農漸感自己年齡變大，記性也不如從前，害怕忘記自己所嘗試過的藥草、種子，便尋到一山洞，開始編篆草經。
日子一天天過去，神農花了十年時間編成一本草經。這十年間，他自山林中開闢出一塊田地，開始試種藥草乃食物種子，搭起一座木架。嘗試著保存藥草之法，儲存糧食之法。最終是了數千斤各種糧食。神農以絲織布，把這些糧食裝好，準備帶**中種植。
神農嘗完百草，爲洪荒人族找到了醫病祜邪的草藥，便下山回去。等他離開這片木林後，晾曬藥草與糧食而遍山搭木架突然不見了。原來，那些搭架的木桿，因助神農編著草經制取糧食有了大功德，落地生根，淋雨吐芽。年深月久，竟然長成了一片茫茫林海。
此後，人族爲了紀念神農嘗百草、造福人間的功績，這處神農編草經種糧食的一片茫茫林海，取名爲“神農架”。
神農回到部族之後，上一代族長已經去世，族人便推舉神農爲族長。神農成爲部落之長後，便挑選族中聰慧之人，傳與其草經，讓他們爲族人治病療傷，族人因傷病去世的逐漸減少，而後又大力推廣種植之術，把自己所帶回來的種子都種入田地之中。
如此，烈山部落越來越興盛，越來越強大。
族人感念神農，把神農編等的草經取名爲《神農百草經》，烈山部更名神農部落。周圍部落知神農部興盛，紛紛來投，神農真心接納他們。待其如己出，投奔而來的各部落漸漸歸心。
神農賢名漸漸被衆部所傳，伏羲得知後，便決定招神農前去，考較他一番，決定等自己大限到時，把共主之位傳於神農。
……
話說，神農部落北方十萬裡處，有一個人族中型部落，名叫有熊，依靠在姬水附近，部落領名曰少典氏。他的夫人兩個，一位名叫女登。一位名叫附寶，乃是姐妹，爲有氏之女。有一天晚上，附寶見一道電光環繞著北斗樞星。附寶大奇，跑到落部外的小山上觀看，隨即，那顆樞星就掉落了下來，附寶由此感應而孕。
少典氏知曉後，與族人傳言：共主之母與效外遇巨掌之印，以腳丈之。有孕，十二年生一子，爲人主共主伏羲；烈山部，又有神農落地有詳兆，賢名傳於天下；今附寶觀北斗樞星而孕，有熊部當有一位賢人降臨。遂傳遍天下，衆部落都知有熊將有大賢出世。
附寶懷胎十個月後，生下一個小兒。這小兒剛剛出生，有熊部落的外面就來了一個道人。
少典聽聞有修士到來，不敢怠慢，放下孩子，急急忙忙迎了出了。迎到部落的門口，少典看見一穿月白道袍的修士，相貌非凡。少典急忙施禮，問道：“道長前來有熊部，不知所爲何事？”
這道人見到少典後，打一稽還禮，笑著說道：“貧道乃盤古玉清聖人元始天尊弟子廣成子，聞有熊部將有賢人降臨，特來收令兒爲徒，與貧道回山修行。”
少典一聽，馬上興高采烈的帶著廣成子進了部族，去看望小兒。進了屋子後，少典請廣成子上座。自己陪在下，吩咐手下的族人去叫附寶帶著新生的小兒前來。
不多時，附寶抱著一個孩子旁邊來到。正與少典談話的廣成子的目光不禁投到了那孩子的身上，滿意的點了點頭，對少典說道：“此子天生的道胎，紫氣盈庭，乃是一塊璞玉，於我玉虛一脈有緣。”
附寶不知道什麼事情，相問少典。聽聞了這仙師要來收徒弟，其忙上前，“這孩子初生，還未取名。不如道長給他取個名字可好？”
廣成子點點頭，低頭想了想。忽見部落萬里之外，有紅光溢出，連忙切算一番，不由面帶笑容。原來那裡乃是軒轅丘。傳聞軒轅丘乃是女奶伏羲化形孕生之地，便對附寶說道：“這孩子將有大成就，又生於軒轅丘附近。貧道便與他取名軒轅。如何？”
“軒轅？”附寶低聲念道，覺悟的這個名字好聽，另有玄奧，便興奮的向廣成子行禮，“多謝道長賜名，吾兒便叫軒轅。”
廣成子又與他夫婦二人說道：“今貧道特來收徒，此子當爲我親傳弟子，貧道現要帶其回山細心教導，待十八年後軒轅自會歸來。不知二位意下如可？”
附寶聞言不捨，其乃聰慧之人，知軒轅得仙師看中，將來必成大器，便看向少典，見少典微微點頭，同意讓廣成把軒轅帶走。
廣成子見少典夫婦已然同意便說道：“那貧道就將其帶走，十八年後貧道便會放其歸來。”說完便駕祥雲向九仙山飛去。
再說神農被伏羲招見，伏羲考教了神農很多問題，神農都能答上，伏羲十分高興，便將神農留在陳地作爲自己的助手處理一些事物。
慢慢的伏羲將所有的事都交給烈山氏來處理。如此過了三年之後，神農已經能夠很好的處理人族之事。各部落公正相待，便是自己部落有人犯錯，也不循私，衆部落拜服。伏羲見如此，便決定把共主之位禪於神農。
有一日，突然天空飛來詳雲，卻是人教教主太上老君之徒玄都大法師駕臨陳都，伏羲迎其入內，玄都大法師對伏羲說：“貧道奉人教教主太清聖人道德天尊之命，前來告訴人皇。人皇已然功德圓滿，當將皇之位傳於他人，功成身退，到火雲洞靜修。”
伏羲聽到此言大喜，本以爲自己大限將臨，不久於人世，沒想到卻來了仙左，說自己到火雲洞靜修小忙讓人準備傳位之事。玄都大法師傳訊完畢後便回陽山去了。
數日後伏羲祭拜天地、人族聖母、人教教主，在洪荒人族見證之下。將人皇之位讓給神農氏。就見在伏羲將皇位傳給神農氏的時候，天上降下霞光照在伏羲身上，須臾霞光散去，就在天降功德加身的時候。伏羲便已恢復了前世的記憶，證得天皇之位。
伏羲轉身對神農說道：“皇弟，爲兄如今證得天皇聖位，望皇弟好生經營人族，日後功德圓滿，定可的與爲兄與火雲洞再見！”