送走了諸位藩王以後，朱有孝開始集中精力改造大明朝的海軍艦隊了，目前的海軍艦隊主要是集中在東南部沿海地區，這些艦隊的火炮也是老式的實心彈，現在的作戰方式還主要以登船搏殺爲主，對於直接擊沉對方的艦船還是不太多，關鍵是炮彈威力太小，除非是大艦隊遇到小船，可以直接擊沉。

戚金的部隊有一部分老兵就是在船上長大的，所以在孫承宗和戚金回來之後，朱有孝纔開始正是決定這個問題的。朱有孝的意思是直接把戚金的部隊改編成海軍，這些精兵都是經過戰場拼殺出來的，有較好的心理素質，再加上他們也都熟悉新式火炮的應用，這樣一來他們很快就可以成軍，迅速形成戰鬥力。

戚金對於皇上欲將其部隊轉爲海軍非常高興，這標誌著皇上對自己的重視。戚家軍自從抗擊倭寇開始，一直很注重海軍士兵的訓練，要不然的話也不會有對倭寇的海上圍剿取得絕對性的勝利。但是自從戚家軍被調到薊州以後，海軍方面的戰例就再也沒有了，只剩下陸戰蒙古人的戰例了，而且其戰果輝煌勝過了海戰，但是這並不意味著海戰方面的人才就沒有了，而是成了海陸戰鬥兩方面都具備的人才了，這纔是朱有孝更看重戚家軍的原因，再加上現在戚家軍擴編之後變成了神機營，以後再加以訓練就是標準的大明朝海軍陸戰隊的雛形。這樣一來，這支部隊無論海戰還是陸戰，都將是大明朝的精銳部隊。

建設海軍首先要建設的就是軍艦，現在的軍艦都是木製的，朱有孝想建立的則是由鋼鐵打造的戰艦，但是對於目前的鋼鐵產量和質量來說，這事還不太現實的，所以朱有孝也只能像歷史上那樣一步一步的前進，首先製造的是鐵甲艦隊。但是就算是這樣，船隊的動力問題也不太好解決，蒸汽機的動力還是很小。在朱靈和宋應星、徐光啓、畢懋康的共同努力下，在經過近半年的研究和試驗中，他們發現有一個重要的問題不好解決，那就是潤滑問題，在曲軸連接處的關節點上，經常有發熱現象，造成了溫度過高使用壽命過短，朱有孝想了想就告訴他們可以用蓖麻油或者菜籽油試一下，最後實驗結果是蓖麻油效果更好。另外還有蒸汽機的調速問題、汽缸溫度問題、傳送動力問題等，這些都是一時半會不還解決的問題。對於這些問題朱有孝雖然心中有解決的辦法，但還是沒有直接講出來，他怕自己說的太多妨礙了這些大牛們的思維能力，讓他們形成解決不了問題就找皇帝的習慣，但是，也講了一點離合器、變速器原理。其他的朱有孝只是讓他們自己去在實踐的過程中發現問題，繼而解決這些問題，哪怕因此失去了製造艦船的時間向後拖延也在所不惜。

經過這麼長時間以來，朱靈他們也終於製造出了一臺可以實用的蒸汽機來，雖然功率不是太高，但是如果用來裝在比較小的船舶上還是可以當做動力的。爲了不浪費太多的材料，朱有孝決定把這一臺可以實用的原始蒸汽機爲藍本，試製十二臺同樣的蒸汽機來試驗大明朝的三等福船，一共建造三艘這樣的鐵甲船，每艘船使用四臺蒸汽機。明朝的福船分爲五個級別，最大的有近二十丈長，四丈寬，六丈高，最小的也有四丈長，一丈寬。一等福船不是用來做戰艦的，就相當於現在的補給艦，二等福船是用來做戰艦的，設計的比較結實，三等福船是用來巡哨的，行駛速度比較快。

朱有孝選擇的是一艘十二丈長，三丈寬，五丈高的三等福船來做實驗。因爲二等福船太大，朱有孝怕它的結構有問題，禁不住加農炮的反震，萬一把戰船開炮的時候震壞了，那就出大笑話了，尤其是現在根本就沒有計算承受能力的合適辦法，朱有孝只能採取更穩妥的辦法。爲了更穩妥起見，朱有孝還讓宋應星製造了四根十丈長的鋼柱放在龍骨裡面，以加強福船的抗震性能，然後在以這四根鋼柱爲龍骨加以橫向的細鐵柱。本來朱有孝是打算使用鋼管的，但是現在鋼管想做成這樣長度的太困難了，所以只好用鋼柱代替。在這些鋼鐵龍骨的外面，正常使用普通的木製龍骨，這樣這艘三等福船就用了雙龍骨，而且還把加農炮設計在福船的前後兩頭，側面則暫且不設置大炮，每艘福船設計爲八門加農炮，前後各四門，中間以迫擊炮防守，在此基礎上建設起來的福船自然可以經受比較大的加農炮震動。現在用的基本上都是實心彈，還是以登幫戰爲主要方式，故此還在船的周圍包了一寸厚的鋼板，甲板上也在下面鋪了一寸厚的鋼板，這樣一來就算實心彈砸到船上，經過木板的減震後鋼板可以徹底保護好船體不受損害，另外又準備一些沙包，防止鐵彈滾動傷人。在增加了鋼甲之後三等福船的重量自然增加了不少，幾乎和二等福船的重量差不多，但是因爲有了蒸汽機作爲動力，朱有孝還是對這三艘鐵甲船抱有很大希望。

這三艘三等鐵甲福船因爲主要火力在前後兩端，所以戰鬥時就以正面對敵，並且因爲有鋼板防護，可以承受敵人的實心彈砸擊，因此要求在距敵方較近的時候才能開炮，以得到最高的最好的炮擊效果，因爲採用的全部是***，而且現在的觸發引信不太好，必須碰到對方船上才能爆炸，所以基本上是在一里遠左右開始開炮。對於現在的普通木製艦船來說，最大的不過二十四丈長，五丈寬左右，這在五里以外看來不過只有二丈左右大小，以現在的射擊準確性，在這個距離開炮能夠命中的概率不到千分之一，就算使用上炮鏡和計算工具，命中率也不會超過千分之五，而這三艘鐵甲福船主要以正面船頭對敵，相對來說受攻擊面積更小，一旦靠近對方一里左右，加上炮鏡的幫助，命中率就應該能達到百分之五十，尤其是如果對方以側弦開炮時面積更大，命中率會更高，雖然對方的命中率也會提高，但是鐵甲船的抗打擊能力更好，並且實心彈攻擊面積很小，***攻擊的殺傷力可以覆蓋幾乎十分之一的面積，而且迫擊炮在這個距離上的射程最佳，這樣一來船上的加農炮和迫擊炮同時攻擊一艘敵艦的話，一個回合就能讓其沉沒。

朱有孝還讓鐵甲福船上裝備四挺手搖機槍，如果對方萬一接近到福船，還可以在近距離內用機槍掃射，這對於裝備大刀和後膛槍的對手來說，絕對是噩夢，不但搶不了自己的船，而且還會把他們的船給送上門來，這樣還可以剩下自己造船的錢來。

戚金和士兵們在新式鐵甲福船造好之前還要在老式戰艦上訓練，在朱有孝的協調下，從南部調過來部分老式艦船。戚金鼓勵士兵，凡是訓練成績突出的官兵將優先接手新式艦船，新式戰船的威力和保命機會要比老式艦船高上無數倍。