涼國公府位於皇城中軸線的盡頭，最初是朱元璋的別院，在洪武二十一年的時候藍玉大破元軍後班師回朝以後賞賜給他的，這件事情還引起了許多大臣的反對，但是朱元璋力排衆議，最終還是把宅子賞賜給了他，由此也可以看出來朱元璋對藍玉的厚愛。但是，隨著朱元璋集權思想的加強，藍玉的所作所爲卻越來越不被朱元璋喜歡，終於，朱元璋要拿他開刀了。
這一天一大早，藍玉纔剛剛起牀，正準備出去吃飯，卻聽見前院裡傳來一陣嘈雜的聲響，不由得惱怒道：“大清早的，誰在外面喧譁？”他雖然長得五大三粗，但是他卻是個喜歡清靜的人，院子裡到處都是移栽來的大樹。
“老爺，不得了了，錦衣衛來抓人啦。”藍玉剛準備洗臉，外面的管家衝進來大聲叫喊。
藍玉一個轉身，“哐當”地一聲，把銅盆碰倒在地上，熱水四濺，慌得旁邊的丫鬟趕緊蹲下來把他身上的誰擦乾淨。“你是什麼？錦衣衛？”藍玉的聲調都變了，他天不怕地不怕，卻只是怕聽到這三個字，目睹了那麼多大臣家破人亡，他很清楚錦衣衛三個字對他來說意味著什麼。
“各位，有何貴幹哪？”藍玉來到前院，看見門口站著站著一隊錦衣衛，爲首的人正是指揮使蔣瓛。後面跟著十數人，面無表情地站成兩隊。
藍玉走向前來，對蔣瓛說道：“蔣大人，好久不見了。”蔣瓛卻不和他說話，只是拿出一封聖旨來念道：“涼國公，接旨吧。”
突然，一股不安的情緒，瀰漫在藍玉的心頭，他緩緩地跪了下來，他後面的也只好跟著他一起跪下。
“奉天承運,皇帝詔曰：藍玉北擊胡虜，報國之心，天地可鑑，特賜白璧一雙，兼太子太傅，別召馮勝、傅友德歸朝，令兼太子太師。欽此。“藍玉鬆了一口氣，道:”謝主隆恩。“蔣瓛道：”恭喜涼國公了。“藍玉笑道：”各位遠道而來，還請稍坐，管家，看茶，大人，請。“一行人在院子裡喝了茶又在走了，藍玉擦了一把額頭上的汗，暗道一聲好險，他看著院子裡的下人們，揮手道：”看什麼看，都散了，散了。“他拿著聖旨左看右看，暗自思忖，朱元璋的這一手，到底是什麼意思？太子太傅，爲什麼太子太師給了傅友德那個傢伙？不過他轉念一向，現在太子都沒有了，這個太子太師和太傅又有什麼區別？只不過是閒職頭銜罷了。還要老子去謝恩。
蔣瓛回到宮裡，立即來到向朱元璋覆命。”事情辦好了嗎？“朱元璋知道是蔣瓛來了，直接問道。
蔣瓛答道：”回稟皇上，您吩咐的事情都辦好了。“朱元璋道：”好，接下來的事情我相信你不會讓我失望吧。“蔣瓛道：”請皇上放心，臣這就去辦。“……
次日，皇上應藍玉邀請擺駕涼國公府，錦衣衛在涼國公府邸搜出兵器若干，皇上震怒。
洪武二十六年，錦衣衛指揮蔣瓛告發藍玉謀反，下獄鞫訊後，獄詞稱同景川侯曹震、鶴壽侯張翼、舳艫侯朱壽、定遠侯王弼、東筦伯何榮及吏部尚書詹徽、戶部侍郎傅友文等謀反，擬乘朱元璋藉田時發動叛亂。朱元璋遂族誅藍玉等，並株連蔓引，自公侯伯以至文武官員，被殺者約兩萬人。朱元璋還手詔佈告天下，並條例爰書爲《逆臣錄》。列名《逆臣錄》者，有一公、十三侯、二伯。
“藍獄”恐怖波及藍玉故里城步扶城，當地藍姓居民改從秦姓，而藍玉定居地安徽定遠的藍姓居民則全部改姓青氏。與藍玉同裡並有世交關係的黔國公沐春爲保存藍玉遺脈，將身懷有孕的藍玉侍妾藏於沐府，得遺腹子藍昌建。成化中，藍昌建子孫繁盛，而“藍獄”禁網日漸廢弛，黔國武僖公沐琮便命藍昌建回原籍城步扶城“世守王墳”，使扶城藍氏得以傳宗接代。
著名的周莊富豪沈萬三沈家也受到籃玉案牽連，從此徹底敗落。
當然，這件事情沒那麼簡單，聖旨上還提到了一個人，傅友德。按照明史的記載，1495年初（洪武二十八年）潁國公傅友德，奏請給懷遠田千畝，非但不準，反將他賜死。定遠侯王弼，居家嘆道：“皇上春秋日高，喜怒不測，我輩恐無噍類了。”爲這一語，又奉詔賜死。宋國公馮勝，在府第外築稻場，埋甔地下，架板爲廊，加以碌碡，取有鞺鞳聲，走馬爲樂。有怨家入告明太祖，訐勝家居不法，稻場下密藏兵器，意圖謀變云云。明太祖遂召勝入，賜酒食慰諭道：“卿可安心！悠悠衆口，朕何至無端輕信？”言下，甚是歡顏。勝以爲無虞，儘量宴飲，誰知飲畢還第，即於是夜暴病，害得七孔流血，數刻即亡。
藍玉案是自胡惟庸案後又一大案，幾乎把明初打天下的大臣誅殺了個乾乾淨淨。一時間，朝野上下，風聲鶴唳。
總計明朝開國功臣，只有徐達、常遇春、李文忠、湯和、鄧愈、沐英六人，保全身名，死皆封王。但徐、常、李、鄧四公，都死在胡藍黨獄以前，沐英留鎮雲南，在外無事，得以考終。湯和聰明，見太祖疑忌功臣，便告老還鄉，絕口不談國事，所以享年七十。
按照朱元璋的說法，他誅殺大臣是爲了後代能夠好好地治理國家，沒有大臣造反的顧慮，可是，雖然造反的大臣沒有了，但是想造反的王爺卻都了，爲什麼？因爲朱元璋把能打仗的人幾乎全部消滅了，那些王爺自然也就肆無忌憚了。這就好比，蛇被吃光了之後，老鼠就多了。
藍玉案鬧得人心惶惶，可是朱允文卻幾乎沒有收到影響，只是朱元璋叫他不能出宮了，其他的一切照舊。朱允文倒也樂得自在，除了吃喝拉撒以外基本上就在逗兒子中度過。