爪哇的面積有十二萬平方公里，根據朱駿的旨意，在全面佔領爪哇島之後，正式將爪哇島併入大明，改名爲定海省，成爲大明版圖上的第十個省份，吏部已在雅歌達攻破之後立即派駐了布政使、按察使、都指揮使等官員立即上任主政，僉事、經歷、知事、照磨、檢校、司獄、都事、理問、庫使等從屬官員更是數以百計。
爪哇原本就被荷蘭人納入了殖民統治之下，因此布政使的人選也不必由當地土人擔任，對於這些原本就沒有任何政治權利的土人來說，荷蘭總督的統治與大明布政使的統治並沒有什麼區別，因此，當地土人對此並未表示出任何的熱情，也沒有做出任何的反對，只是麻木的看著總督府被人換上了布政司的匾額，看到原本手持著火槍在街上巡檢的荷蘭士兵變成了黑色輕甲，手持鋼弩、火銃的明兵。
新官上任，第一件要做的事便是清查府庫、人丁，維持本地的治安，治安倒也好說，當地的土人乖巧的很，除了一些盜竊、毆鬥之外並沒有什麼聳人聽聞的事鬧將出來，清點府庫也容易的很，幾個庫使帶著幾十個典吏，再帶上百來個明兵在倉庫內造冊登記了三天結果便出來了，其中白銀總計四百餘萬兩，黃金近兩萬兩，珍奇珠寶不計其數，價值也在一百萬兩白銀以上，另外還有一百七十萬枚銀幣另外登記造冊。
檢查戶口是最麻煩的，不過根據荷蘭人的一些記載來看，人口應在二十萬上下，其中歐洲僑民兩萬七千人，漢人九千人。剩餘的便是當地土著了。
另外，戰利品也有了統計結果，其中大型西洋戰艦共繳獲五艘，各種戰船二十餘艘，一些歐洲商人的商船有近兩百艘，火炮九百七十們?；鹚幉挥嬈鋽?，火銃五千七百門，彈丸不計其數。
根據朱駿下發地旨意，這些西洋戰艦統統交由東洋營水師營訓練作戰之用，這讓劉國軒激動了很久。連忙派人前往南洋水師營學習大型戰艦的航行作戰經驗，又親自帶著人登船接收，有了這些戰艦，東洋水師營正式拋離傳統的戰船足以成爲遠洋艦隊了，雖然比起南洋水師營來實力尚缺，但也不再是依靠登船近戰爲主的水師了。
繳獲的商船全部發賣給海都的海商，譬如海都最大地海商巨頭馬仁，如今他已經成爲了南洋第一鉅商。下屬商船足有百條之多，這時聽說明軍又有折扣的商船發賣，早已憑藉著他與皇上有數面之緣的關係預訂了八十艘，他的船隊縱橫南洋各國。往來發賣四方的貨物，甚至一些小國地國主都要看他臉色行事。
海都城其他海商也不遑多讓，許多人自遷到海都之後，生意陡然擴大了數倍不止，原先行船時既會害怕海盜侵襲，又要接受各國港口的稅官索賄，一路上下來損耗巨大，可自從遷往海都之後，每次行船都有數十名明軍陪護，尋常小蟊賊並不放在眼裡。大的海盜看見船上的大明日月旗也不敢輕易劫持。否則過不了幾天，大明的艦隊便會抵達事發海域。並且在四周進行排查，直到找到這夥海盜的聚居點全部清除乾淨爲止。而且船隊到了貿易的港口。該國的稅官也不敢勒索，南洋已有十之八九地國家向大明稱臣，海商們打著上國商賈的身份，船上還有個明軍伍長陪護，誰敢要錢？損耗少了，賺取的利潤自然也高了不少，貪婪的海商便會不斷地購買造船廠中的新船增強自己的運輸能力以此來賺取更多的利潤，這樣一來，擁有數十條海船的鉅商在海都並不稀奇，也吸引了更多的海商向海都搬遷，兩年的功夫，海都城已經成爲了南洋海洋貿易的中樞，南洋商船鉅萬，海都城的商船便佔去了一半。
清點完畢之後，爪哇島由敢死營指揮使王秋率五千陸軍，南洋水師營指揮使劉二鎮守，劉國軒所率的東洋水師營大小艦船百條開始將所有戰利品與俘虜裝船揚帆向海都駛去。
劉國軒在四天之後抵達海都港口時，立時受到了海都百姓地熱烈歡迎，羣情激昂地海都百姓如今多少都識得幾個字，也能夠從邸報中讀懂這一次遠征對於大明的好處，更加知道勝利地來之不易，在得知劉國軒抵達之後，幾乎所有人都擠到了海港觀看凱旋而歸的戰士和垂頭喪氣地紅毛俘虜。
劉國軒見沿岸人頭攢動的望不著邊際，除了興奮之外心裡也不由得有些發毛，連忙扮成了小兵的裝束與一干士卒們登岸逮著了個機會溜出了港口，他得先去兵部點卯報到，說不定還要受皇上的接見詢問戰爭的經過，因此不敢怠慢。
“臣東洋水師營指揮使劉國軒拜見皇上。吾皇萬歲萬歲萬萬歲?！?
寒冬閣裡。朱駿正翻閱著今日地邸報。這個時候。劉國軒在小太監地指引下走了進來。納頭便拜。
朱駿擡眸望了劉國軒一眼。又繼續看著手裡心學邸報地一篇文章。過了半晌。正當劉國軒兩腿痠麻地時候纔將邸報放到御案上。道：“平身吧。劉愛卿遠征歸來。辛苦了。給劉愛卿看坐?！?
劉國軒小心翼翼地欠身坐下。朱駿又道：“劉愛卿此次凱旋而歸。想必總結了些海戰地心得吧。給朕說說看。”
劉國軒早在船上便想好了如何應對皇上地各種奏對。卻偏偏沒有想到皇上會與自己討論心得。於是振作精神。沉吟道：“末將原先以爲海戰不過是靠近敵船相互拼殺而已。這一次算是開了眼界。此次海戰若不是南洋水師營在後策應。用火炮掩護我營地快船迅速登岸。恐怕要想獲勝定會付出數倍地代價。因此。末將以爲。將來地大洋之上必定是炮船地天下。從前依靠船體碰撞依靠勾索登上敵船近戰地方式早晚都要淘汰。末將以爲。水師營應該勤加操練炮手。海上使用火炮十分不易。一來是由於艦船顛簸。角度會有偏差。二來海風也是飄忽不定。不易命中目標。因此。同樣地炮船。雙方能否得勝。炮手地經驗佔去了大半地作用。其次舵手也要專門進行訓練。許多舵手平時倒還罷了?？墒且坏┡R戰。便難免會手忙腳亂。一旦不能及時轉舵。便釀成了大禍……”
朱駿撫案聽了片刻。不由得點了點頭。眼眸中流出一絲讚賞。歷史中地劉國軒能文能武。下海就成了優秀地海軍將領。上岸就成了一方父母。防洪救災、推廣稻種。這些東西。若你對它們一竅不通是辦不到地。劉國軒之所以能有此成就?？峙戮褪怯幸还赡軌蚣皶r發現破綻。並且加以改善地勁頭。
“你是東洋水師營的指揮使，以上的問題都由愛卿自去解決吧，如何操練炮手、舵手，如何行船，如何作戰，你都要好好體會?！敝祢E說了一番無關痛癢的話，接著攤開一張邸報道：這是心學邸報上刊登的一篇文章，你可以瞧瞧對水師有沒有用處?！?
劉國軒起身碎步的走到御案前，恭敬的接過邸報，映入眼前的先是許多海軍大勝以及自己得勝回朝的文章，在右側角則是一篇關於海戰的論述，撰寫人是一名叫毛文靜的翰林院侍講，上面指出的問題竟然與自己的觀點相似，都是舵手、炮手的一些問題，還有關於風力的論述，這個時代的戰艦都是依靠風帆動力行駛，在西方，熟悉和掌握風力是所有優秀海軍將領的必要知識，這篇文章字數並不算多，也嘗試著提出了幾個解決炮手、舵手訓練問題的方法，更多的卻是闡述借用風力的問題，劉國軒認真的看完，愣愣的仍然咀嚼著文章的內容，與自己的經驗相互印證，時而點點頭，有時又嘆息一聲搖頭，半晌之後，這回過神來，忙向朱駿告罪道：“皇上恕罪，末將失禮了?！?
朱駿揮揮手：“無妨，愛卿看看，此人的文章所提的方案是否可行？”
劉國軒道：“按理來說確實可行，但是有些恐怕是書生之言了，不過此人未經過海戰，就能提出如此獨到的見解已是非常不易，若讓他跟著水師營出海兜上幾圈，說不定此人是個帥才?！?
朱駿笑道：“朕就是要讓他跟著劉愛卿身邊學一些行船海戰的經驗，此人的理論功夫十足，眼光犀利，若是能讓他隨船走走，說不定將來能堪大用。”
劉國軒連連笑著稱是。
朱駿道：“他是個書生，既然朕讓他跟了你，你就要好好的照顧他，儘量給他一些方便。朕的講海堂還指望他來執教呢。對了，你還不知道這事吧？朕來給你說說講海堂的計劃吧?！?
朱駿興致盎然的招手讓劉國軒靠前一些，將自己建立講海堂的構思一一說出來，其實講海堂不過是講武堂的另一個培育軍官的方式。只不過講武堂培育的是陸軍方面的軍官，而講海堂培養的是海軍軍官而已。
劉國軒的理解能力極快，片刻功夫便已是點頭口稱明白。