補給艦隊滿載著第二次聖島之戰的成果全速駛向美國大本營，而剩下的美軍艦隊因爲敵我不分的電磁武器陷入了癱瘓。美軍本來使用的電磁武器功率並不是很大，但因爲後來美軍陷入了頹勢，必須一舉消滅所有的天空一號！
加上電磁武器還未完全研製成功，電磁功率超過了美軍預料的數十倍！美軍的艦隊和聖島各種機器人雖然能抵禦相當程度的電磁武器，但是增加數十倍威力的電磁武器讓雙方都陷入癱瘓！
不過聖島之上單一的武裝機器也是失敗的原因之一，除了天空一號和陸軍一號，聖島之上只有爲數不多的幾種後勤機器人。
一號智者預料到外界在第一次聖島之戰中獲得的成果會加速科技，特別是武器科技的發展，但是外界比大長老想象的複雜很多！
“這就是外界的力量！他們並不是一無是處，比起一百年前他們已經有了長久的進步，外界的世界比我們想象的要大很多！以前是我們太故步自封了！”，第七智者看著全息屏幕上揚長而去的美軍補給艦隊心中一股複雜的情緒涌上來，他的判斷是對的，但是他又不希望自己是對的！
“自從我們走下坡路開始我就已經預料到今天的成果了，我本以爲他們要發展到半隻腳踏入三級文明纔會擊敗我們，但是我們輸得很慘！”，第一智者在屏幕上繼續下達著命令。
“看來現在聖島之上就我們兩個老不死了！”
“唉，死在戰場之上也是這些戰士的夙願，我能做的只有給他們一個轟轟烈烈的戰鬥了，就算沒有這場戰鬥，他們也沒幾年壽命了！”
“沒想到內戰之後帶來的不是倒退而是消亡！而且是消亡在這羣外界人手裡！”
“我們本來和他們就是一類人，不過是我們運氣比較好而已！我們本質上並沒有什麼差異，現在這個所謂的亞特蘭蒂斯文明應該到了她消失的時候了。”，第一智者按下了最後的指令，前方出現了一個倒計時一分鐘的紅色方框。
“我還是覺得我們所謂的那個“神”身上有很多疑點！首先就是授意我們在人類社會中散步各種亞特蘭蒂斯文明這個名字，讓外界人相信在地球上有這樣一個文明曾經存在過！還有“神”神秘消失之後就立刻開始了第一次內戰，我總感覺後面有一隻手在推動著這些事！”，第七智者在生命的最後問出來困擾他一生的迷題。
第一智者似乎知道知道很多內幕，畢竟他是聖島之上最聰明的人！
“其實我們只不過是一隻稍微有點用的棋子罷了，有人在布一局很大的棋！亞特蘭蒂斯文明只不過是一個名字罷了，並沒有什麼實際意義，幕後之人想達到的目的似乎只是爲了讓自己有這樣一個身份罷了！”
“身份？”，第七智者對第一智者的話表示不理解，一個強大如斯的幕後勢力爲什麼要費盡心思的獲得一個所謂的“身份”？
“其實什麼所謂的五紀文明都只不過是杜撰加上歷史造假！地球根本就沒有這樣的文明存在過！我懷疑像我們這樣的棋子至少有四個！”，第一智者話中的信息量很大，第七智者一隻腳已經邁入了真相的大門！他馬上就能觸摸到最本願的真相，但隨即第七智者緩緩將腳收了回來。
“這又有什麼意義呢？知道的太多也是一種錯誤，就讓你一人揹負這一切吧！哈哈哈！”，第七智者忽然開心的笑了起來。
聽到第七智者的笑聲，第一智者不由得搖搖頭，“沒想到最後了還被你算計一波！知道真相確實在某種程度上來說是一件令人痛苦的事情，這次你贏的很漂亮！”，說著第一智者也笑了起來，現在聖島之上只剩下了兩個最聰明的聖島人在肆意的笑著。
“你真的不打算走了嗎？超時空轉換器還可以使用一次，雖然只能傳送幾百斤的物體，但是在聖島沉沒之前也算夠用了！”
“那你呢？你不打算繼續回到你的外界麼？”
第七智者搖搖頭，“我並不屬於那裡，我這次回來的目的就是能夠與這個記憶中的聖島一同消失於歷史的長河！”
“就算我能在沉沒之前逃出去，我又能去那裡呢？我一個人茍活在異鄉又有什麼意義呢？”，第一智者早就已經打算陪著聖島一起沉沒。
“和你鬥了一生，沒想到我們最後落到了這樣一個結局！”
在一百年前，“神”忽然消失，沒有了限制的第七智者制訂了佔領美洲的戰略計劃，而其他智者分別瓜分亞洲和歐非澳洲，那時候的各國的坦克飛機都未出世，對上聖島的強大力量自然只能引頸就戮。
但是不知爲何，內戰開始了，一夜之間聖島陷入了戰火，無數的浮島沉沒於海底。可能是他們相信即使聖島上只存在百分之一的力量也可以征服整個世界的原因，漸漸的戰爭打出了真火！
曾經聖島數百萬的人口也因爲戰爭減少到了不足百萬，雖然內戰的主力軍是機器人，但因爲他們的武器威力實在是太大了，在沒有戰略縱深的情況下，每經過一次戰役，作戰雙方都會損失巨大！
或許這也是因爲聖島上並沒有平民這樣一種“職業”，所有人都參與到科研、戰爭或者是後勤，到第二次聖島內戰時，之間建造的人工大型浮島也是十不存一，人數也僅僅十幾萬！
本來要停息的內戰不知爲何再起！在這第三次聖島內戰中，只有第七和第一智者存活下來，其他智者和他們的勢力都在內戰中消失殆盡。
第三次內戰結束後消耗的不止是大量的物力財力，還有整個聖島的未來！倖存下來的聖島人已經失去了完整的工業體系，即使存在著先進的武器，但也只能夠維修和使用。聖島之上從此連一個螺絲釘都無法制造，當然這和中央智腦的“死亡”有很大的關係。
最後一代的聖島人甚至不知道爲什麼要戰爭，因爲他們生下來就在打仗，所以他們長大後也加入了這場戰爭，但大多數人甚至已經不知道什麼時候開始的內戰！