“世界末日”之夜，方遠在“七彩陽光”咖啡店遇見十幾年未曾謀面的白如，交談間，兩個人目睹了店內(nèi)發(fā)生的血案，涉案人李彤臨終前向方遠披露了一個重要秘密。據(jù)此，方遠得到了一個神秘的筆記本，從此他開始了探索秘密之路。方遠出乎意料地被聘爲(wèi)C市黃河刑警大隊的技術(shù)顧問，在測試一款遊戲軟件過程中意外受傷，住進了白如所在的醫(yī)院。在住院期間，方遠被醫(yī)生進行了秘密實驗，從實驗者的對話中方遠震驚於自己身體內(nèi)存在一種神秘的“酵母”元素。方遠和警方在圍繞咖啡店“血案”進行的調(diào)查過程中，發(fā)生了連環(huán)殺人案，每個兇案現(xiàn)場都發(fā)現(xiàn)了一個“七色球”。在偵破兇案的的過程中，筆記本中的秘密開始被一層一層地揭開，《簡森計劃》浮出了水面，故事中的人物一一登場。